Syndykaty są systemem Reputacji opartym o frakcje; gracze mogą złożyć im przysięgę, zyskując doświadczenie i nagrody za rozgrywanie misji. Im więcej czasu gracz poświęci danemu Syndykatowi, tym lepsze nagrody otrzymuje. Reputacja każdego Syndykatu jest podzielona na Rangi, każda z których wymaga złożenia Ofiary, aby przejść na następny poziom. Wraz ze zwiększeniem Rangi, rośnie także wartość Ofiary.
Niektóre z tych frakcji konkurują i walczą między sobą. Praca dla jednego z takich Syndykatów podniesie Reputację także u jego sojuszników, ale obniży Reputację o rywali. Większość Syndykatów oferuje 5 pozytywnych poziomów Reputacji i 2 negatywne.
Gracze mogą zdobywać nagrody zdobywając Reputację, ale mogą także popaść w niełaskę syndykatu i konieczne będzie spłacenie długów, zanim możliwe będzie uzyskanie tych korzyści.
Informacja o obecnym stanie Syndykatów jest dostępna z poziomu terminala po lewej stronie kokpitu Orbitera, lub po odwiedzeniu Syndykatów w Przekaźnikach.
Informacja o Syndykatach jest także dostępna w aplikacji mobilnej Warframe na iOS i Androidzie
Sojusznicy i Wrogowie
Każdy Syndykat oferuje inną pulę nagród i przedmiotów do zdobycia przez graczy, ale praca na przysługi jednego sprawi też, że gracz podpadnie innym, przeciwstawnym Syndykatom.
Przed wyborem Syndykatu, gracze powinno zapoznać się z opisem Syndykatu, oferowanymi przez nich nagrodami oraz sojuszami.
Gracz może sprzymierzyć się z dowolnym Syndykatem w każdej chwili i pracować dla nich niezależnie od stanu swojej Reputacji. Jeśli gracz wypadł z łask któregokolwiek Syndykatu, konieczne będzie zapracowanie na powrót do pozytywnych Rang.
Kiedy gracz nie jest lubiany przez Syndykat, możliwe jest pojawienie się Zabójców Syndykatu, którzy spróbują zabić gracza.
Pierwsza ofiara
Wybierając Syndykat po raz pierwszy, gracz zostanie poproszony o złożenie ofiary, małego daru na symbol przyjaźni wobec Syndykatu, za który otrzyma w zamian odznakę frakcji - Znak. Ta inicjacja przeniesie gracza na neutralną Rangę 0 w danym Syndykacie.
Gracze mogą zmienić Przysięgę w każdej chwili, aby konwertować część Biegłości zdobytej podczas misji w Reputację Syndykatu, pozwalając na postęp aż do osiągnięcia Dziennego Limitu.
Powyżej rangi zero
Po zebraniu wystarczającej ilości Reputacji, gracz zyskuje możliwość złożenia ofiary i podniesienia swojej Rangi w Syndykacie. Ofiara jest wymagana tylko przy pierwszym osiągnięciu rangi.
Osiągnięcie Rangi 1 odblokowuje dostęp do dziennych Misji Syndykatu. Te misje frakcji mogą zostać rozpoczęte z poziomu Okna Stanu Świata.
W tych misjach ukryte są Medaliony, w każdej misji Syndykatu może pojawić się ich do ośmiu. Po zebraniu Medaliony można wymienić na Reputację w pokoju Syndykatu na Przekaźniku.
Rywalizujące Syndykaty
Stalowy Meridian
Dowodzony przez dezerterkę Grineer, weterankę wielu bitew, Stalowy Meridian prowadzi walkę partyzancką przeciwko potężnemu wrogowi.Są zaprzysiężonymi obrońcami tego, co pozostało z kolonii.
Sojusznicy: Czerwony Woal (+50%)
Rywal: Nowa Loka (-50%)
Wróg: Sekwencja Perrin (-100%)
Arbitrzy Hexis
Dogmatyczni Arbitrzy dążą do prawdy poprzez dyscyplinę i trening.
Odrzucają Tenno jako mit Wojowników... uznają go za kłamstwo, które ogranicza ich potencjał.
Sojusznicy: Cefalon Suda (+50%)
Rywal: Sekwencja Perrin (-50%)
Wróg: Czerwony Woal (-100%)
Cefalon Suda
Potężna świadomość o ciekawskim charakterze.
Na pierwszy rzut oka pozbawiona emocji, jednak żądzę wiedzy i odrazę do zniszczenia Cefalon Sudy można określić tylko jako żarliwe.
Sojusznicy: Arbitrzy Hexis (+50%)
Rywal: Sekwencja Perrin (-50%)
Wróg: Czerwony Woal (-100%)
Sekwencja Perrin
Kolektyw błyskotliwych i potężnych kupców, którzy odłamali się od Corpus.
Ich celem jest przywrócenie porządku poprzez zaprowadzenie dobrobytu i nadanie kierunku brutalnemu światu, który badają.
Sojusznicy: Nowa Loka (+50%)
Rywal: Arbitrzy Hexis (-50%)
Wróg: Stalowy Meridian(-100%)
Czerwony Woal
Woal widzi korupcję wszędzie wokół.
Zaprzysiężeni na honor, zobowiązali się uzdrowić system poprzez wielką, krwawą czystkę.
Żadna cena nie jest zbyt wysoka, żadna krew nie jest zbyt cenna.
Sojusznicy: Stalowy Meridian (+50%)
Rywal: Cefalon Suda (-50%)
Wróg: Arbitrzy Hexis (-100%)
Nowa Loka
Wojna może zostać zakończona tylko przez odbudowę czystej ludzkości i ponowne zaludnienie Ziemi.
Nowa Loka czci ludzką formę i Ziemię z czasów przed ich spaczeniem.
Sojusznicy: Sekwencja Perrin (+50%)
Rywal: Stalowy Meridian (-50%)
Wróg: Cefalon Suda (-100%)
Neutralne Syndykaty
Te Syndykaty nie mają na siebie bezpośredniego wpływu, jedynym sposobem na utratę Reputacji tych Syndykatów jest wykupywanie Darów.
Gracz może zdobyć Reputację Syndykatu wykonując określone zadania, takie jak Zlecenia (Ostroni, Zjednoczone Solaris, Entrati), Synthesis (Cefalon Simaris) lub wymieniając przedmioty za Reputację, podobnie do Medalionów.
Ostroni
Zbita grupka handlarzy, kramarzy i rozbitków, Ostronowie nazywają Cetus swoim domem. Miasto zostało zbudowane wokół Wieży Orokin, która zarówno osłania jak i żywi mieszkańców.
Quillowie
Skryci i szanowani, Quillowie są najbliższymi sługami Unum. Dziwni i trzymający dystans, więź jaka łączy ich pomiędzy sobą i z Unum, tworzy dziwny związek z przyczynowością. "Wszyscy jesteśmy ledwie jednym ze światopoglądów, które składają się na miliardy tworzące Unum. Patrzymy, przewidujemy i podejmujemy działanie."
Zjednoczone Solaris
Zaciągnięci robotnicy do Corpusu; niezastąpiony szkielet modelu biznesowego Corpus na Wenus. Ludzkie fabryki, ciągniki kolejowe i kopalnie pracują, aby spłacić sztuczne ciała (platformy), które kupili, aby pracować.
Vox Solaris
Główny personel Zjednoczonego Solaris działają pod przykrywką enigmatycznej i anonimowej figurantki tej grupy. ZS jest publicznym obliczem walki. Vox Solaris jest czymś zupełnie innym; czymś znanym tylko Eudico... i Quillom.
Nawiewniaki
Nawiewniaki przesiadujące wraz ze swoją logiczną ekipą w kanałach wentylacyjnych Fortuny dorabiają sobie, kradnąc części od Corpus i organizując wyścigi K-Drive’ów po Vallis. Nocą kanały rozbrzmiewają – ku ubolewaniu innych mieszkańców – ich donośną muzyką skeg.
Entrati
Spadkobiercy spuścizny Albrechta Entratiego, tą wpływową rodzinę Orokin spotkało nieszczęście, izolacja i gorzki rozłam na Deimosie. Przybycie Tenno, beneficjentów ich badań nad Pustką, może przynieść nową nadzieję - i głębsze zrozumienie świata więżącego ich rodzinę.
Nekraloid
Podczas gdy kohorta śmiercionośnych Nekramechów rodziny Entrati uległa korumpującemu wpływowi Deimosa, tarcze Loida utrzymały go przy zdrowych zmysłach, a także chroniły pozostałość jego „pasażera”, Cefalona Otaka. Razem podtrzymują dumną tradycję lojalnej służby.
Zatrzymani
Obdarowana nowym istnieniem przez tajemniczą siłę Pustki, czwórka Zatrzymanych walczy o zachowanie zdrowego rozsądku i utrzymanie statku w nienaruszonym stanie. Powrót Tenno może odwrócić ich passę.
Zwierzęta wysłane do Pustki przez Albrechta Entratiego, trójka ocalałych spośród Cavii powróciła odmieniona na zawsze. Cavia zyskała ludzki intelekt, ale mogły przemówić tylko w Języku Pustki - dopóki Gargulec Jahu nie uczynił ich bełkotu zrozumiałym. Pomimo krzywd wyrządzonych przez Albrechta, Cavia zadecydowała pomóc wybranemu przez niego Operatorowi.
Hex
Szóstka agentów Hex została przemieniona w Protoframe przez Albrechta Entratiego. Przepełnieni nadzwyczajną mocą i żalem utraconego człowieczeństwa, ich misja uratowania podupadłej Höllvanii nadal trwa.
Cefalon Simaris
Dzięki Syntezie zdołamy zachować, co istnieje i odbudować, co przepadło. Przywołaj nieśmiertelne widma wspomnień w oazie danych. Czy jesteś gotowy na oświecenie, Tenno? Czy zapolujesz dla mnie?
Konklawe
Wojownik wzrasta tylko wtedy, gdy stawi czoła wrogowi ostatecznemu. Samemu sobie. Główny artykuł: Konklawe i Pojedynki